|
|
یافته های نوین در علوم زیستی، جلد ۹، شماره ۴، صفحات ۲۷۹-۲۸۸
|
|
|
| عنوان فارسی |
جداسازی برخی از باکتری‌های میکروبیوم شور دریاچه ارومیه |
|
| چکیده فارسی مقاله |
دریاچه ارومیه بزرگترین دریاچه داخلی ایران و دومین دریاچه شور دنیا است. برای شناسایی باکتری‌های کاملاً شور پسند دریاچه از طریق غربال با مارکرهای مولکولی، طی فصول مختلف سال‌های 1397 و 1398 از آب، لجن و خاک مناطق مختلف دریاچه نمونه‌هایی جمعآوری و به آزمایشگاه منتقل گردید. با استفاده از محیط‌های کشت عمومی جدایه‌های باکتریایی از نمونه‌ها جداسازی و برای بررسی تنوع گونهای از نشانگر مولکولی ERIC استفاده گردید. پس از خوشهبندی ژنتیکی گونهها، از هر خوشه یک باکتری به‌عنوان نماینده انتخاب و با رمزینهگذاری ناحیه 16srDNA مورد شناسایی قرار گرفتند. تستهای بیوشیمیایی برای تایید نتایج مولکولی انجام گردید. در مجموع، 102 جدایه باکتری از نمونه‌ها جداسازی شد که فقط 29 جدایه بسیار شورپسند بودند. نشانگر مولکولی ERIC نشان داد که جدایه‌ها میتوانند به پنج گروه منتسب شوند. پنج جدایه منتخب از هر خوشه، با آغازگرهای ناحیه 16SrDNA تکثیر و توالی‌یابی شدند که نتایج نشان داد که پنج جدایه منتخب با اطمینان 99 درصد متعلق به گونه‌های Microbulbifer halophilus،Halomonas salina، Bacillus sonorensis،Salinivibrio costicola و Bacillus aquimaris هستند. نتایج شناسایی مولکولی با نتایج آزمونهای بیوشیمیایی مطابقت داشت.
|
|
| کلیدواژه‌های فارسی مقاله |
اریک پی‌سی‌آر، دریاچه ارومیه، میکروبیوم، شورپسند |
|
| عنوان انگلیسی |
Isolation of some bacteria for halophilic microbiome of Urmia Lake |
|
| چکیده انگلیسی مقاله |
Urmia Lake is the largest lake in the Iranian plateau and the second largest Salt Lake in the world. This study was conducted to identify hypersaline bacteria in the lake through the screening with molecular markers. For the molecular study of the bacterial microbiome of the lake, samples were collected from water, sludge and soil of the different parts of the lake during different seasons of 2018 and 2019, and then transferred to the laboratory under standard conditions. Bacterial isolates were purified from the samples using universal culture media. ERIC molecular marker was used to study the species diversity. After clustering analysis of the species on the basis of their genetic markers, one bacterium from each cluster was selected as the representative of each cluster and then identified by DNA barcoding method using the 16srDNA. Biochemical tests were performed to confirm the molecular results. In total, 102 bacterial isolates were isolated and purified from the samples, of which only 29 isolates were extremely-halophilic. The molecular diversity of isolates, based on ERIC molecular marker, showed that isolates can be assigned to five different clusters. Five isolates selected from each cluster were selected and their 16SrDNA region were amplified and sequenced with 16SrDNA-specific primers. The results showed that the five selected isolates with 99% similarity belonged to the species Microbulbifer halophilus, Halomonas salina, Bacillus sonorensis, Salinivibrio costicola and Bacillus aquimaris. The results of molecular identification were consistent with the results of biochemical tests.
|
|
| کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله |
ERIC-PCR, Halotolerant, Microbiome, Urmia Lake |
|
| نویسندگان مقاله |
مهری فرزندی | Mehri Farzadi
Plant Protection Department, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran
گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
رضا خاک ور | Reza Khakvar
Plant Protection Department, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran
گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
ابولقاسم محمدی | Abolghasem Mohammadi
Plant Biotechnology and Breeding, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran
گروه به‌نژادی و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
توماس راتای | Thomas Rattai
Department of Microbiology and Ecosystem Science, Faculty of Life Sciences, University of Vienna, Vienna, Austria
گروه میکروبیولوژی و علوم اکوسیستم، دانشکده علوم‌زیستی، دانشگاه وین، وین، اتریش
|
|
| نشانی اینترنتی |
http://nbr.khu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1443-1&slc_lang=fa&sid=1 |
| فایل مقاله |
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است |
| کد مقاله (doi) |
|
| زبان مقاله منتشر شده |
fa |
| موضوعات مقاله منتشر شده |
میکروبیولوژی |
| نوع مقاله منتشر شده |
مقاله پژوهشی |
|
|
|
برگشت به:
صفحه اول پایگاه |
نسخه مرتبط |
نشریه مرتبط |
فهرست نشریات
|
