|
|
یافته های نوین در علوم زیستی، جلد ۴، شماره ۳، صفحات ۲۰۱-۲۰۸
|
|
|
| عنوان فارسی |
ارزیابی تنوع ژنتیکی و گروه بندی اکوتیپ های مختلف هندوانۀ با استفاده از نشانگرهای مولکولی SRAP |
|
| چکیده فارسی مقاله |
تعداد 38 توده و رقم مهم هندوانه از مناطق مختلف کشور جمع آوری و پس از آماده سازی خاک، در مزرعۀ تحقیقاتی در قالب طرح بلوک های کامل تصادفی با سه تکرار کشت شد. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی، DNA از برگ استخراج و واکنش زنجیرهای پلیمراز با استفاده از 14 جفت آغازگر SRAP بهینه شد. تعداد 136 باند چندشکل به دست آمد، که جفت آغازگر EM10-Me4 با تعداد نوزده باند و جفت آغازگرهایEM16-Me4 و EM16-Me4 با تعداد هفت باند به ترتیب بیشترین و کمترین تعداد باند چندشکل را ایجاد کردند. محتوای اطلاعات چندشکل (PIC) در این تحقیق بین 20/0 تا 32/0 و میزان تنوع ژنی براساس شاخص نی از 17/0 تا 28/0 به دست آمد. تجزیۀ تابع تشخیص خطی فیشر نشان داد که روش UPGMA و با انجام صحت گروهبندی در حدود 90 درصد، مناسبتر از دیگر روش های تجزیۀ خوشه ای است. تجزیۀ خوشه ای براساس روش جاکارد توده های تحت مطالعه را در پنج گروه مجزا قرار داد. تجزیه به مختصات اصلی نشان میدهد که مؤلفه های اول و دوم 5/92 درصد از تنوع به دست آمده را توجیه می کنند که خود نشان دهندۀ توزیع مناسب نشانگرها در کل ژنوم است. |
|
| کلیدواژه‌های فارسی مقاله |
تجزیۀ خوشه ای، تنوع ژنتیکی،PCR ، SRAP |
|
| عنوان انگلیسی |
Evaluation of genetic diversity and classification of watermelon (Citrullus lanatus) ecotypes using SRAP molecular markers |
|
| چکیده انگلیسی مقاله |
Thirty eight ecotypes of watermelon were collected from different parts of Iran. After the preparation of the field, these eotypes were cultivated in a completely randomized block design with three replications. In order to invest-igate genetic diversity, genomic DNA samples were extracted from leaves and Polymerase chain reactions were optimized using 14 SRAP primer pairs. One hundred thirty six polymorphic bands were detected, of which the EM10-Me4 was the most abundant primer pair with 19 bands and EM16-Me4 and EM16-Me14 were the least primer pairs with 7 bands. PIC index varied from 0.20 to 0.32 and genetic diversity was 0.17 to 0.28 on the basis of Nei index. Fisherchr('39')s Linear Detection Analysis showed that the UPGMA method and the grouping accuracy of about 90% are more appropriate than other cluster analysis methods. Cluster analysis, using Jakard method, was performed and the ecotypes studied were classified into five distinct groups. Based on the PCA, the first and second components included 92.5% of the variation, which represents the proper distribution of the markers on the whole genome. |
|
| کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله |
cluster analysis, genetic diversity, PCR, SRAP |
|
| نویسندگان مقاله |
مریم عبدلی نسب | Maryam Abdoli Nasab
Graduate University of Advanced Technology, Kerman,
دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفتۀ کرمان
مهدی رحیمی | Mehdi Rahimi
Graduate University of Advanced Technology, Kerman,
دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفتۀ کرمان
|
|
| نشانی اینترنتی |
http://nbr.khu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-302-3&slc_lang=fa&sid=1 |
| فایل مقاله |
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است |
| کد مقاله (doi) |
|
| زبان مقاله منتشر شده |
fa |
| موضوعات مقاله منتشر شده |
علوم جانوری |
| نوع مقاله منتشر شده |
مقاله پژوهشی |
|
|
|
برگشت به:
صفحه اول پایگاه |
نسخه مرتبط |
نشریه مرتبط |
فهرست نشریات
|
