|
|
یافته های نوین در علوم زیستی، جلد ۵، شماره ۴، صفحات ۴۵۸-۴۶۵
|
|
|
| عنوان فارسی |
بررسی مقایسه ای سه روش استخراج DNA ژنومی از نمونه های تازه و گیاکده ای برگ بومادران کوتاه دشتی |
|
| چکیده فارسی مقاله |
استخراج DNA از بافتهای گیاهی اغلب مشکلاتی را فراهم میسازد. بطورمثال عدم حذف متابولیتهای ثانویه نظیر ترکیبات فنلی گیاهان معطر و دارویی، باعث بروز خطا در نتایج کاربرد DNA استخراج شده طی آزمایش های مولکولی میشود. بومادران (Achillea wilhelmsii)، گیاهی دارویی متعلق به تیره کاسنیان (Asteraceae) و انحصاری ایران است که اطلاعات کمی در رابطه با ژنوم آن وجود دارد. بدین جهت بهینهسازی روشهای استخراج برای تهیه DNA با کمیت و کیفیت مناسب ضروری به نظر میرسد. در این مطالعه دو روش سنتی استخراج DNA ژنومی از برگ گیاه بومادران (با استفاده از بافت تازه و گیاکدهای) و یک روش دیگر با استفاده از کیت استخراج تجاری MAGNANTM مورد مقایسه قرار گرفته است. نتایج نشان داد که استخراج DNA از برگهای تازه طبق دستورالعمل Khanuja و همکاران (1999) به دلیل افزایش مقدار DNA استخراج شده و کاهش آلودگی ترکیبات مزاحم مثل RNA، پلیساکاریدها، پروتئینها و متابولیتهای ثانوی بهتر از دو روش دیگر بود. ارزیابی کیفیت DNA استخراج شده از نمونههای گیاکدهای نشان داد که علیرغم مقدار بالای DNA (50-10 برابر نسبت به دو روش دیگر)، کیفیت عصاره روی ژل آگارز بخاطر وجود کشیدگی و شکستگی مولکول DNA پایین بود. این امر میتواند استفاده از عصاره فوق را در آزمایشهای مولکولی با محدودیت روبرو سازد. کاربرد کیت استخراج MAGNANTM گرچه از نظر کاهش زمان و هزینه استخراج و کاهش آلودگی به پروتئین و RNA مناسب بود، اما نیازمند اصلاح فرایند تخلیص برای گیاه بومادران جهت افزایش کمیت DNA حاصل است.
|
|
| کلیدواژه‌های فارسی مقاله |
استخراج ژنومی، بومادران، پلی فنل ها، نانوذرات مغناطیسی، نمونه خشک |
|
| عنوان انگلیسی |
Comparison study of three methods for genomic DNA extraction from fresh and herbarium leaf specimens of Achillea wilhelmsii C.Koch |
|
| چکیده انگلیسی مقاله |
DNA extraction from plant tissues often causes most problems. For example, unsuccessful removal secondary metabolites during extraction, such as phenolic compounds in aromatic and medicinal plants, cause to some mistakes in result of molecular experiments by using of the extracted DNA. Achillea wilhelmsii is a medicinal plant belong to Asteraceae family and native to Iran, there is little information about genomic data in this plant. Therefore, optimizing of the DNA extraction methods for obtaining suitable quality and quantity yield is necessary. In this study, two traditional DNA extraction methods (using fresh and herbarium leaf samples) and commercial DNA kit MAGNANTM in Yarrow have been compared. Results showed that DNA extracted from fresh leaves of yarrow according to Khanuja et al. (1999) was better than the other methods which mentioned in this research, because of the increased amount of extracted DNA and reduced harmful compounds such as RNA, polysaccharides, protein and secondary metabolites. To evaluate the quality of extracted DNA from herbarium specimens showed that, in spite of the high yielding DNA (10-50 fold ratio to the other methods), quality of this extract was low on agarose gel because of smear and broken down the molecules. It can be considered as a limitation of the extract in molecular experiments. Procedure of MAGNANTM DNA kit was appropriate for reducing time and cost of the extraction as well as low contamination to protein and RNA, but the process needs some modifications for yarrow to increase the amount of extracted DNA. |
|
| کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله |
Achillea wilhelmsii, genomic DNA extraction, herbarium samples, magnetic nanoparticle, polyphenols |
|
| نویسندگان مقاله |
عذرا صبورا | Azra Saboora
alzahra university
دانشگاه الزهرا
مریم امیری راد | Maryam Amiri Rad
alzahra university
دانشگاه الزهرا
عزت عسگرانی | Ezat Asgarani
alzahra university
دانشگاه الزهرا
طیبه رجبیان | Tayebeh Radjabian
shahed university
دانشگاه شاهد
|
|
| نشانی اینترنتی |
http://nbr.khu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-177-1&slc_lang=fa&sid=1 |
| فایل مقاله |
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است |
| کد مقاله (doi) |
|
| زبان مقاله منتشر شده |
fa |
| موضوعات مقاله منتشر شده |
علوم گیاهی |
| نوع مقاله منتشر شده |
مقاله پژوهشی |
|
|
|
برگشت به:
صفحه اول پایگاه |
نسخه مرتبط |
نشریه مرتبط |
فهرست نشریات
|
