|
|
یافته های نوین در علوم زیستی، جلد ۶، شماره ۴، صفحات ۳۷۴-۳۸۱
|
|
|
| عنوان فارسی |
تشخیص مولکولی عامل طاعون بر اساس ژن pla |
|
| چکیده فارسی مقاله |
یرسینیا پستیس عامل بیماری طاعون، باسیلی گرم منفی متعلق به تیره انتروباکتریاسه است. تشخیص این ارگانیسم بر اساس روش های کلاسیک وقت گیر، پر هزینه و خطرناک است. هدف از این مطالعه طراحی روش TaqMan Real-time PCR برای تشخیص سریع این باکتری بر اساس ژن pla است. در این مطالعه واکنش Real-time PCR بر اساس ژن هدف pla بهینه سازی گشت. برای تعیین حساسیت، از ژن pla رقتهای سریال تهیه و آخرین رقتی که سیگنال فلورسنت تولید کرد به عنوان کمترین حد تشخیص در نظر گرفته شد. بر اساس نتایج آزمایش تعیین حساسیت، منحنی استاندار شامل مقادیر Ct و تعیین کمیت برای آنالیز ژن هدف استفاده گردید. ویژگی آنالیتیکال روش به وسیله انجام آزمایش بر روی ژنوم تعدادی از باکتریهای کنترل منفی ارزیابی گردید. در این بررسی، در نمودار تکثیر ژن pla هیچ گونه تکثیری برای نمونههای کنترل منفی مشاهده نشد و ویژگی واکنش تایید گشت. کمترین حد تشخیص روش Real-time PCR برای ژن هدف fg 4/5، همچنین کمترین تعداد کپی از ژن هدف در یک واکنش 20 میکرولیتر در حدود 103× 1 تعیین گشت.
. |
|
| کلیدواژههای فارسی مقاله |
ریل تایم پی سی آر، کنترل منفی، منحنی استاندارد، ویژگی، یرسینیا پستیس |
|
| عنوان انگلیسی |
The molecular detection of the causative agent of plague on the basis of the pla gene |
|
| چکیده انگلیسی مقاله |
Yersinia pestis, a gram-negative rod belonging to the Enterobacteriaceae family, is the causative agent of plague. Classical methods of detecting the organisms are time-consuming, expensive and dangerous. The aim of the study was to design a Real-time PCR assay on the basis of the pla gene of Yersinia pestis. In this research the Real- time PCR test was optimized by using special primers for targeting pla gene. After preparing 10-fold serial dilutions of the pla and their analysis by the assay, the last dilution showing a fluorescent signal was confirmed as the limit of detection (LOD). A standard curve based on the Ct values was depicted, so the assay was developed to quantify the target gene. The analytical specificity was determined by subjecting the genome of some control negative bacteria to the assay. In this experiment, negative control genomes did not show detectable signals in the assay. The last dilution of pla plasmid which showed a fluorescent signal was 4.5 fg. So, the lower detectable copy numbers of the gene in a 20 μl PCR reaction was calculated as 1×103.
|
|
| کلیدواژههای انگلیسی مقاله |
control negative, Real- time PCR, specificity, standard curve, Yersinia pestis |
|
| نویسندگان مقاله |
خاطره کبیری | Khatereh Kabiri
Department of Microbiology, North Tehran Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
گروه میکروبیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران شمال، تهران، ایران
کیوان مجیدزاده | Keivan Majidzadeh
Tasnim Biotechnology Research Center (TBRC), AJA University of Medical Sciences, Tehran, Iran
مرکز تحقیقات زیست فن آوری تسنیم، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی آجا، تهران، ایران
|
|
| نشانی اینترنتی |
http://nbr.khu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-695-2&slc_lang=fa&sid=1 |
| فایل مقاله |
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است |
| کد مقاله (doi) |
|
| زبان مقاله منتشر شده |
fa |
| موضوعات مقاله منتشر شده |
میکروبیولوژی |
| نوع مقاله منتشر شده |
مقاله پژوهشی |
|
|
|
برگشت به:
صفحه اول پایگاه |
نسخه مرتبط |
نشریه مرتبط |
فهرست نشریات
|
